1996年11月30日公開。全国松竹系劇場にて上映。出崎統監督作品。OVAシリーズの流れを汲む作品で、原作にはない劇場用オリジナルストーリーとして製作したもの。音楽はOVA版KARTE6より参加した川村栄二が担当、主題歌は山根麻衣『Invisible Love』。本作最大の特徴は、キャラクターも含めた作品そのものの米国風のデザインや、患者が血を吐くシーンや頭をぶつけるシーンなどに使われた、サーモグラフィー切り替えによる演出などである。当時の最新の技術を極限まで用いた演出と、出崎監督特有の「ハーモニー」や「陰影」、「入射光」などもあり、人間の「生死」や「苦悩」をリアルに演出している。なお、2005年末、手塚眞監督によって再び映画化された作品がブラック・ジャック ふたりの黒い医者であるが、内容は本作とは全くの別物。なお、前述の2005年度に公開された映画の予告に於いて「初の映画化」と謳っているうえ、一般的なイメージとしてはこちらの映画の方が強いために、本作のイメージは薄れつつある（※公式サイトの豆知識にメディア化作品が記載されているこの作品もそれに記載されているため否定しているわけではない）。ただしDVDレンタルはされているため見ることができる。セルDVDでの発売もされているが、こちらは在庫切れが相次いで入手困難の状況にある。 公開当年の1996年の12月、秋田書店からフィルムコミックが発売されている。全2巻。（1巻：ISBN 4-253-17328-4、2巻：ISBN 4-253-17329-2） 1999年末、よみうりテレビ･日本テレビ系列にて地上波TV放送された。 2008年12月31日（23時45分 - 25時30分）TOKYO MXにての地上波局としては異例の、年を跨いでのアニメ作品放映という形で実施された。
观众对《怪医黑杰克剧场版》的评价两极分化，一方面认为剧情离谱、演员表现惊艳，另一方面认为编剧粗制滥造、剧情不合理。
该片以其深刻的战争描绘和人性的探讨赢得了观众的广泛赞誉。剧中的视觉效果和演员的精湛表演让人深刻体会影片的精彩之处。
它是一部值得一看的电影，通过其故事和表现手法，让观众反思剧内向观众表达的意义和人性的复杂！
这是一部非常特别的影片，没有大开大合的剧情，没有博人眼球的类型元素，没有贯穿到底的故事脉络。像是一杯温开水，看似平淡，却喝起来十分解渴。
说真的，《怪医黑杰克剧场版》看完后我真的是久久不能平静！因为这部影片确实带给人的震撼太大了！不论是剧情节奏，还是剧情尺度，都让人不敢相信这是日本剧的水平。
